Ваш браузер устарел!

Браузер, которым вы пользуетесь для просмотра этого сайта, устарел и не соответствует современным технологическим стандартам Интернета.

Вы можете установить последнюю версию подходящего браузера, воспользовавшись ссылками ниже:


Вернуться к списку ЦКП

Ассоциация центров коллективного пользования «Биоинженерия»

Сокращенное наименование ЦКП: ЦКП «Биоинженерия»

Базовая организация: Федеральное государственное учреждение «Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» Российской академии наук»

Ведомственная принадлежность: ФАНО России

Год создания ЦКП: 2003

Сайт ЦКП: http://www.fbras.ru/services/ckp/ckp-bioinzheneriya

Заказать услуги ЦКП

Контактная информация:

Местонахождение ЦКП:

  • Федеральный округ: Центральный
  • Регион: г. Москва
  • 119071, г. Москва, Ленинский проспект, д. 33, стр. 2

Руководитель ЦКП:

  • Груздев Денис Сергеевич, кандидат биологических наук
  • +7 (499) 1351240
  • borisk@biengi.ac.ru

Контактное лицо:

Сведения о результативности за 2017 год (данные ежегодного мониторинга)

Участие в мониторинге: даЧисло организаций-пользователей, ед.: 12Число публикаций, ед.: 14Загрузка в интересах внешних организаций-пользователей, %: 43.03

Краткое описание ЦКП:

ЦКП оснащен комплексом современного высокопроизводительного уникального научного оборудования – блоком автоматических секвенаторов ДНК (капиллярные ABI3100-3730, пиросеквенатор Roche 454 FLX, полупроводниковый IonTorrent), амплификаторами ДНК, масс-спектрометром, атомно-силовым микроскопом. Методы секвенирования обеспечены метрологической поддержкой. На оборудовании ЦКП выполнены проекты по секвенированию XII хромосомы картофеля, 12 геномов бактерий и архей, диатомовой водоросли и митохондриального генома возбудителя описторхоза Opistorchis felineus. АЦКП «Биоинженерия» предоставляет возможность проведения исследований на имеющемся уникальном оборудовании внешним организациям. За время существования в АЦКП его услугами воспользовались более чем 100 организаций России, стран СНГ и зарубежья.
Спектр предлагаемых услуг АЦКП включает:
•    секвенирование ДНК, полногеномное секвенирование;
•    определение таксономического статуса неизвестного микроорганизма на основе филогенетического анализа 16S рРНК;
•    анализ видового разнообразия микробных и архейных сообществ;
•    исследование аллельного полиморфизма локусов геномной ДНК;
•    разработка методов идентификации заданных генетических мишеней;
•    стажировка специалистов из других научных учреждений.

Направления научных исследований, проводимых в ЦКП:

  • высокопроизводительная геномика, секвенирование геномной ДНК и ПЦР-фрагментов;
  • молекулярно-экологический анализ природных и антропогенных сообществ прокариот на основе филогенетического анализа последовательностей 16S рРНК, а также генов, кодирующих разнообразные функциональные гены бактерий и архей (cbbL, nifH, pufLM, fmoA и т.п.);
  • разработка ПЦР-маркеров для идентификации различных генетических мишеней;
  • поиск и описание новых видов аноксигенных нитчатых фототрофных бактерий (АНФБ), секвенирование и анализ их геномов, реконструкция эволюции АНФБ на ранних этапах развития жизни на Земле;
  • в сотрудничестве с Институтом Питания - разработка и валидирование методов идентификации и количественного анализа ГМО в продуктах питания.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):

    Науки о жизни

Фотографии ЦКП:

Научное оборудование ЦКП: (номенклатура — 18 ед.)

Автоматический капиллярный секвенатор ДНК ABI 3730 (Applied Biosystems)
Марка:  ABI 3730
Фирма-изготовитель:  Applied Biosystems Inc
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1

Анализатор однонуклеотидных полиморфизмов ДНК Illumina5
Марка:  Illumina5
Фирма-изготовитель:  Illumina
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1

Генетический анализатор 4300 (Li-Cor)
Марка:  4300
Фирма-изготовитель:  Li-Cor
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1

Генетический анализатор AVANT 3100 (ABI)
Марка:  AVANT 3100
Фирма-изготовитель:  ABI
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2002
Количество единиц:  1

ДНК амплификатор в комплекте 350 (Parallab)
Марка:  350
Фирма-изготовитель:  Parallab
Страна происхождения:  Швейцария
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1

ДНК-амплификатор Tetrad (MJR)
Марка:  Tetrad
Фирма-изготовитель:  MJR
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  3

Компьютерный кластер
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2003
Количество единиц:  1

Лаборатория для исследования физических свойств объектов со сверхвысоким разрешением Интегра Прима (НТ-МДТ)
Марка:  Интегра Прима
Фирма-изготовитель:  НТ-МДТ
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2010
Количество единиц:  1

Лабораторная установка повышенной степени чистоты
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2003
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Масс-спектрометр Ultraflex III MALDI-TOF/TOF (Bruker)
Марка:  Ultraflex III
Фирма-изготовитель:  Bruker Corporation
Страна происхождения:  Германия
Год выпуска:  2015
Количество единиц:  1

Пиросеквенатор ДНК 454 GS FLX (Roche)
Марка:  454 GS FLX
Фирма-изготовитель:  Roche
Страна происхождения:  Швейцария
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1

Робот для раскапывания реакционных смесей Biomek 2 (Bekmann Coultier)
Марка:  Biomek 2
Фирма-изготовитель:  Bekmann Coultier
Страна происхождения:  Германия
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1

Система анализа последовательностей молекул ДНК IonTorrent (Illumina)
Марка:  IonTorrent
Фирма-изготовитель:  Illumina Inc.
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2012
Количество единиц:  1

Система для проведения пульс-электрофореза ДНК CHEF DR III Chiller (BioRad)
Марка:  CHEF DR III Chiller
Фирма-изготовитель:  BioRad
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1

Система подготовки нуклеиновых кислот ABI PRISM 6100
Марка:  ABI PRISM 6100
Фирма-изготовитель:  ABI
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2004
Количество единиц:  1

Система сбора данных BioDocAnalyser II (Biometra)
Марка:  BioDocAnalyser II
Фирма-изготовитель:  Biometra
Страна происхождения:  Германия
Год выпуска:  2003
Количество единиц:  1

Счетчик частиц Z1 (Beckman)
Марка:  Z1
Фирма-изготовитель:  Beckman Coulter
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1

Фрагментатор ДНК Hydroshear (Genomic Solutions Inc.)
Марка:  Hydroshear
Фирма-изготовитель:  Genomic Solutions Inc.
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  не указано

Услуги ЦКП: (номенклатура — 4 ед.)

Для подачи заявки на оказание услуги щелкните по ее наименованию

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):  Науки о жизни; Рациональное природопользование
Краткое описание услуги:  1. Выделяем тотальную ДНК микробного сообщества. 2. Получаем ПЦР-фрагменты генов, кодирующих 16S рРНК (эубактерии, археи). Возможно получение ПЦР-амплификата, специфичного для заданных функциональных генов (RuBisCo, nifH, pmoA, другие гены). Размер амплификата зависит от варианта исследования. Вариант 1. 1. Получаем клональную библиотеку ПЦР-фрагментов. Как правило, используются полноразмерные амплификаты, к примеру, для 16S рРНК - около 1450 нуклеотидов. 2. Секвенируем заданное число клонов - 25 для сообщества из 2-3 видов, 50 - для 4-7 видов, 100 - для 15-20 видов. На этом этапе получаем частичные последовательности клонированных ПЦР-фрагментов (около 600-700 нуклеотидов) 3. Идентифицируем полученные последовательности - BLAST 4. Для заданных клонов определяем полноразмерную последовательность. Вариант 2. 1. Размер амплификата - около 450 нуклеотидов. 2. Секвенируем ПЦР-фрагменты c помощью NGS. По заказу на 1 сообщество модно получить от 10 до 100 тысяч последовательностей. 3. Анализируем полученные последовательности, разбиваем на группы, определяем наиболее близкие, из известных, виды. 4. Формируем отчет.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):  Науки о жизни; Рациональное природопользование
Краткое описание услуги:  1. Проводим выделение ДНК из исследуемого организма. 2. С использованием праймеров, специфичных для 16S рРНК эубактерий или архей, амплифицируем полноразмерный ПЦР-фрагмент гена, кодирующего 16S рРНК. 3. Секвенируем полученный ПЦР-фрагмент, сравниваем полученную последовательность с последовательностями генов 16S рРНК из баз данных, определяем ближайшие виды 4. По запросу заказчика строим филогенетические деревья, показывающие таксономическое положение исследованного микроорганизма. 5. По запросу заказчика депонируем полученную последовательность в базу данных GenBank. 6. По запросу заказчика формируем филогенетическое описание в публикацию.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):  Науки о жизни
Краткое описание услуги:  Секвенирование ПЦР-фрагмента ДНК, рестрикционного фрагмента ДНК, клонированного фрагмента ДНК в составе вектора

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):  Науки о жизни; Рациональное природопользование
Краткое описание услуги:  1. Проводим выделение ДНК из исследуемого организма. 2. Получаем ПЦР-копию генов 18S рРНК (ядерный геном), COI (митохондриальный геном), других маркеров по запросу. 3. Секвенируем полученные ПЦР-фрагменты, определяем ближайшие последовательности из имеющихся в базах данных (BLAST-анализ) 4. По запросу заказчика строим филогенетические деревья, показывающие таксономическое положение исследованного микроорганизма. 5. По запросу заказчика депонируем полученную последовательность в базу данных GenBank. 6. По запросу заказчика формируем филогенетическое описание в публикацию.

Методики измерений, применяемые в ЦКП: (номенклатура — 8 ед.)

Методика определения содержания трансгенной кукурузы GA21 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика определения содержания трансгенной кукурузы MON801 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика определения содержания трансгенной кукурузы NK603 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика определения содержания трансгенной кукурузы Т25 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика определения содержания трансгенной сои RR40-3-2 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика секвенирования геномной ДНК исследуемого организма
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям
Дата аттестации:  03.10.2011

Методика секвенирования клональной вставки
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям
Дата аттестации:  03.10.2011

Методика секвенирования ПЦР-фрагмента ДНК
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям
Дата аттестации:  03.10.2011

Вернуться к списку ЦКП

 

Для просмотра сайта поверните экран