Центры коллективного пользования

Ассоциация центров коллективного пользования «Биоинженерия» (ЦКП «Биоинженерия»)

ЦКП создан в 2003 году

Данный ЦКП был поддержан в рамках мероприятия 5.2 ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направления развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы»
Адрес
Руководитель
Контактное лицо
Сведения о результативности за 2016 год (данные мониторинга)
Участие в мониторинге Число организаций-пользователей, ед. Число публикаций, ед. Загрузка в интересах внешних организаций-пользователей, %
да161723.31
Базовая организация

Федеральное государственное учреждение «Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» Российской академии наук»

Информация о центре коллективного пользования (ЦКП)

ЦКП оснащен комплексом современного высокопроизводительного уникального научного оборудования – блоком автоматических секвенаторов ДНК (капиллярные ABI3100-3730, пиросеквенатор Roche 454 FLX, полупроводниковый IonTorrent), амплификаторами ДНК, масс-спектрометром, атомно-силовым микроскопом. Методы секвенирования обеспечены метрологической поддержкой. На оборудовании ЦКП выполнены проекты по секвенированию XII хромосомы картофеля, 12 геномов бактерий и архей, диатомовой водоросли и митохондриального генома возбудителя описторхоза Opistorchis felineus. АЦКП «Биоинженерия» предоставляет возможность проведения исследований на имеющемся уникальном оборудовании внешним организациям. За время существования в АЦКП его услугами воспользовались более чем 100 организаций России, стран СНГ и зарубежья.
Спектр предлагаемых услуг АЦКП включает:
•    секвенирование ДНК, полногеномное секвенирование;
•    определение таксономического статуса неизвестного микроорганизма на основе филогенетического анализа 16S рРНК;
•    анализ видового разнообразия микробных и архейных сообществ;
•    исследование аллельного полиморфизма локусов геномной ДНК;
•    разработка методов идентификации заданных генетических мишеней;
•    стажировка специалистов из других научных учреждений.

Направления научных исследований

  • высокопроизводительная геномика, секвенирование геномной ДНК и ПЦР-фрагментов;
  • молекулярно-экологический анализ природных и антропогенных сообществ прокариот на основе филогенетического анализа последовательностей 16S рРНК, а также генов, кодирующих разнообразные функциональные гены бактерий и архей (cbbL, nifH, pufLM, fmoA и т.п.);
  • разработка ПЦР-маркеров для идентификации различных генетических мишеней;
  • поиск и описание новых видов аноксигенных нитчатых фототрофных бактерий (АНФБ), секвенирование и анализ их геномов, реконструкция эволюции АНФБ на ранних этапах развития жизни на Земле;
  • в сотрудничестве с Институтом Питания - разработка и валидирование методов идентификации и количественного анализа ГМО в продуктах питания.

Приоритетные направления
119071, г. Москва, Ленинский проспект, д. 33, стр. 2
📷

Оборудование (18)

Наименование Страна Фирма-изготовитель Марка Год
Автоматический капиллярный секвенатор ДНК ABI 3730 (Applied Biosystems)
Соединённые Штаты Америки Applied Biosystems Inc ABI 3730 2006
Система анализа последовательностей молекул ДНК IonTorrent (Illumina)
Соединённые Штаты Америки Illumina Inc. IonTorrent 2012
Масс-спектрометр Ultraflex III MALDI-TOF/TOF (Bruker)
Германия Bruker Corporation Ultraflex III 2015
Фрагментатор ДНК Hydroshear (Genomic Solutions Inc.)
Соединённые Штаты Америки Genomic Solutions Inc. Hydroshear 2007
Пиросеквенатор ДНК 454 GS FLX (Roche)
Швейцария Roche 454 GS FLX 2006
Счетчик частиц Z1 (Beckman)
Соединённые Штаты Америки Beckman Coulter Z1 2007
Система для проведения пульс-электрофореза ДНК CHEF DR III Chiller (BioRad)
Соединённые Штаты Америки BioRad CHEF DR III Chiller 2007
Генетический анализатор 4300 (Li-Cor)
Соединённые Штаты Америки Li-Cor 4300 2007
Система сбора данных BioDocAnalyser II (Biometra)
Германия Biometra BioDocAnalyser II 2003
Компьютерный кластер
Россия 2003
Генетический анализатор AVANT 3100 (ABI)
Соединённые Штаты Америки ABI AVANT 3100 2002
Система подготовки нуклеиновых кислот ABI PRISM 6100
Соединённые Штаты Америки ABI ABI PRISM 6100 2004
ДНК амплификатор в комплекте 350 (Parallab)
Швейцария Parallab 350 2006
Робот для раскапывания реакционных смесей Biomek 2 (Bekmann Coultier)
Германия Bekmann Coultier Biomek 2 2006
Лабораторная установка повышенной степени чистоты
Россия 2003
Лаборатория для исследования физических свойств объектов со сверхвысоким разрешением Интегра Прима (НТ-МДТ)
Россия НТ-МДТ Интегра Прима 2010
Анализатор однонуклеотидных полиморфизмов ДНК Illumina5
Соединённые Штаты Америки Illumina Illumina5 2006
ДНК-амплификатор Tetrad (MJR)
Соединённые Штаты Америки MJR Tetrad 2006

Услуги (4)

Методики (8)

Наименование методики Наименование организации, аттестовавшей методику Дата аттестации
Методика секвенирования ПЦР-фрагмента ДНК ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям 03.10.2011
Методика секвенирования клональной вставки ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям 03.10.2011
Методика секвенирования геномной ДНК исследуемого организма ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям 03.10.2011
Методика определения содержания трансгенной кукурузы Т25 в продуктах питания ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека 05.02.2006
Методика определения содержания трансгенной кукурузы MON801 в продуктах питания ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека 05.02.2006
Методика определения содержания трансгенной кукурузы GA21 в продуктах питания ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека 05.02.2006
Методика определения содержания трансгенной кукурузы NK603 в продуктах питания ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека 05.02.2006
Методика определения содержания трансгенной сои RR40-3-2 в продуктах питания ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека 05.02.2006

Возврат к списку


0 комментариев

Комментарии отсутствуют!

Вы можете оставить свое сообщение первым.

Написать комментарий