Ваш браузер устарел!

Браузер, которым вы пользуетесь для просмотра этого сайта, устарел и не соответствует современным технологическим стандартам Интернета.

Вы можете установить последнюю версию подходящего браузера, воспользовавшись ссылками ниже:


Вернуться к списку ЦКП

Региональная профилированная коллекция алканотрофных микроорганизмов

Сокращенное наименование ЦКП: ИЭГМ

Базовая организация: Институт экологии и генетики микроорганизмов Уральского отделения Российской академии наук ‒ филиал Федерального государственного бюджетного учреждения науки Пермского федерального исследовательского центра Уральского отделения Российской академии наук

Ведомственная принадлежность: ФАНО России

Год создания ЦКП: 2017

Сайт ЦКП: http://www.iegmcol.ru/

Заказать услуги ЦКП

Контактная информация:

Местонахождение ЦКП:

  • Федеральный округ: Приволжский
  • Регион: Пермский край
  • 614081, г. Пермь, ул. Голева, д. 13

Руководитель ЦКП:

  • Ившина Ирина Борисовна, доктор биологических наук, профессор, академик РАН
  • +7 (342) 2808114
  • ivshina@iegm.ru

Контактное лицо:

Сведения о результативности за 2017 год (данные ежегодного мониторинга)

Участие в мониторинге: даЧисло организаций-пользователей, ед.: 12Число публикаций, ед.: 30Загрузка в интересах внешних организаций-пользователей, %: 45.92

Краткое описание ЦКП:

ЦКП «Региональная профилированная коллекция алканотрофных микроорганизмов» (акроним коллекции ИЭГМ, номер 768 во Всемирном центре данных о микроорганизмах, WCDM, www/iegmcol) (далее «Коллекция ИЭГМ») основан согласно приказа № 1252/1а от 09 декабря 2017 г. на базе Федерального государственного бюджетного учреждения науки Институт экологии и генетики микроорганизмов Уральского отделения Российской академии наук (ИЭГМ УрО РАН).
ЦКП «Коллекция ИЭГМ» руководствуется действующим законодательством Российской Федерации, распоряжениями Правительства РФ и Федерального агентства научных организаций (ФАНО России), Уставом и внутренними распоряжениями ИЭГМ УрО РАН, Регламентом порядка формирования коллекции и Положением о коллекции.
Загрязнение окружающей среды углеводородами еще долго будет оставаться глобальной экологической проблемой. Обусловлена она беспрецедентными по своим масштабам объемами освоения природных ресурсов, главными из которых являются нефтяные углеводороды. Сегодня масштаб загрязнения природной среды нефтью и нефтепродуктами значительно превосходит существующие объемы рекультивационных работ. Отсюда - устойчивое нарастание фундаментального интереса к изучению углеводородокисляющих микроорганизмов (их геномов, метаболизма, адаптивных реакций), поиску ключевых биоокислителей, новых биодеструкторов и путей их биотехнологической эксплуатации, в частности для диагностики загрязнений и нефтяной биоремедиации.
Основное направление деятельности Коллекции ИЭГМ состоит в выделении, детальном изучении и гарантированном сохранении в жизнеспособном состоянии аутентичных непатогенных штаммов микроорганизмов, ведущих окисление природных и антропогенных углеводородов. Собранный генофонд бактериальных культур с высокой активностью оксигеназного ферментного комплекса - удобный объект для изыскания новых продуцентов ценных веществ, деструкторов и трансформаторов ксенобиотиков и активных биоаккумуляторов ионов тяжелых металлов, а также для конструирования новых форм и создания новых биологических технологий. Биоресурсы коллекции используются в различных областях биотехнологии и защиты окружающей среды – от биоиндикации углеводородных залежей до интенсификации процессов биодеградации нефтяных углеводородов и биокатализа в тонком органическом синтезе.
Коллекция ИЭГМ располагает автоматизированной базой данных,  современными методами характеристики и идентификации культур, а также квалифицированным персоналом, имеющим уникальный опыт работы с углеводородокисляющими микроорганизмами и практику профессионального хранения биотехнологически ценных живых культур. Опыт и профессионализм специалистов позволяет проводить на базе коллекции ИЭГМ сервисные работы по таксономическому анализу штаммов и обучающие курсы с предоставлением рабочего места исследователям для овладения методами детекции, культивирования и идентификации алканотрофов, а также предоставлять консультации по вопросам выделения, таксономии, биологических особенностей и консервации поддерживаемых культур.
Деятельность специализированной коллекции помимо фундаментальных исследований (комплексное изучение биологии алканотрофов, адаптационных механизмов их выживания в антропогенно нарушенных экосистемах) и собственно коллекционной работы (адекватный сбор природного материала, классификация и таксономическое описание изолятов, оценка их биотехнологической пригодности, разработка методов долгосрочного хранения культур и их функционального разнообразия, совершенствование информационного сопровождения культур в соответствии с международными стандартами, обеспечение непрерывности в передаче потребителям штаммов и накопленной научной информации о них) включает прикладные исследования (получение новых препаратов, разработка перспективных технологий) с использованием коллекционного генофонда алканотрофов. Биологическая информация о поддерживаемых штаммах представлена в систематически издаваемых каталогах.
Среди пользователей - различные коллективы отечественных и зарубежных вузов и исследовательских учреждений, специалисты в области микробиологии, биотехнологии, экологии и медицины, инженерно-технические работники промышленных предприятий, преподаватели и студенты вузов. Для учебных целей культуры предоставляются безвозмездно. Биоресурсы коллекции ИЭГМ активно востребованы в рамках федеральных и международных программ (в частности 7 Рамочной программы ЕС по научным исследованиям и технологическому развитию с участием коллекций организаций РФ, Бельгии, Швейцарии, Италии) на базе ЦКП выполняются междисциплинарные проекты с привлечением математиков, химиков, физиков, фармацевтов. Коллекционный генофонд  используется в совместных исследованиях с Институтом микробиологии НАНБ (Беларусь), Университетом Эври (Франция), Университетом Стратклайд (Великобритания) и др. Коллекция ИЭГМ – член vмеждународного проекта по созданию панъевропейской исследовательской инфраструктуры (Microbial Resource Research Infrastructure, MIRRI, www.mirri.org).

ОСОБЕННОСТИ КОЛЛЕКЦИИ
Региональная профилированная коллекция алканотрофных микроорганизмов (официальный акроним ИЭГМ, www.iegmcol) - единственная коллекция, специализирующаяся на сборе, изучении и поддержании аутентичных непатогенных практически ценных микробных культур, деструктирующих нефтяные углеводороды и ксенобиотики. Коллекция ИЭГМ является членом Всемирной федерации коллекций культур, Европейской организации коллекций культур, включена во Всемирный справочник коллекций культур, входит в сеть специализированных российских микробиологических коллекций немедицинского профиля, располагает каталожной базой данных, интегрированной в международную поисковую систему по штаммам микроорганизмов Биологических ресурсных центров, современными методами полифазной таксономии, а также квалифицированным персоналом, имеющим навыки работы с углеводородокисляющими микроорганизмами, таксономический опыт и практику профессионального хранения живых культур. Генофонд коллекции включает около трех тысяч чистых идентифицированных детально охарактеризованных штаммов, выделенных из образцов почв, ризосферы, поверхностных и пластовых вод, снега, воздуха, керна, отобранных из резко контрастных эколого-географических регионов. Принцип отбора штаммов в коллекцию по таксономическим и функциональным критериям − их потенциальная перспективность для работ по биотехнологии и защите окружающей среды. Среди коллекционных культур широко представлены экстремотолерантные штаммы с высокой активностью оксигеназ, имеющие значительный потенциал для промышленной эксплуатации; штаммы-биопродуценты биологически активных соединений (аминокислот, ферментов, биосурфактантов); штаммы-биодеструкторы экополлютантов, в том числе сырой нефти и нефтепродуктов, а также фармэкотоксикантов. Коллекция ИЭГМ располагает типовыми и референтными штаммами, принадлежащими к родам видов Agromyces, Arthrobacter, Brachybacterium, Brevibacterium, Clavibacter, Corynebacterium, Curtobacterium, Dermacoccus, Dietzia, Gordonia, Koсuria, Microbacterium, Micrococcus, Nocardia, Nocardioides, Rhodococcus, Terrabacter, Williamsia (всего 86 видов актинобактерий).
В коллекции собран наиболее полный в стране и за рубежом фонд непатогенных штаммов актинобактерий рода Rhodococcus, выделяющихся среди других микроорганизмов наибольшим разнообразием деградируемых поллютантов. С учетом изученных структурных и физиологических особенностей коллекционных штаммов разработаны оптимальные режимы криоконсервации и лиофилизации культур с предварительно индуцированным алканотрофным обменом. Коллекция ИЭГМ по своему объему, представленному видовому разнообразию, спектру научного и прикладного применения коллекционных штаммов, выполняемым функциям сопоставима с фондами ведущих европейских центров микробных биоресурсов и входит в число российских коллекций, по степени готовности отвечающим требованиям формирования Биологического ресурсного центра.

Направления научных исследований, проводимых в ЦКП:

  • Структура и функция микробных сообществ, оценка роли микроорганизмов в биосферных процессах;
  • Молекулярно-генетические механизмы адаптации микроорганизмов к экстремальным факторам среды, регуляция роста и развития микроорганизмов в экспериментальных условиях и природных экосистемах;
  • Исследование видового и генетического разнообразия, универсальных черт, структурных и функциональных особенностей микроорганизмов природных и нарушенных углеводородами биогеоценозов;
  • Анализ генов метаболизма сложных органических соединений, природные микроорганизмы, селекция высокопродуктивных штаммов и создание устойчивых биокатализаторов, перспективных для получения новых фармакологически значимых соединений и биоремедиации загрязненных экосистем;
  • Коллекционное дело: расширение профиля коллекции, поддержание и пополнение коллекционного генофонда, оптимизация способов хранения коллекционных культур, развитие службы информационного обеспечения, регулярная модернизация базы данных на основе современных информационных технологий.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):

    Науки о жизни

Фотографии ЦКП:

Научное оборудование ЦКП (номенклатура — 15 ед.):

Автоклав вертикальный
Марка:  ВК75
Фирма-изготовитель:  Тюменский завод медицинского оборудования
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  1988
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Автоматизированный оптический микроскоп
Марка:  ОМ 2000
Фирма-изготовитель:  Leica Microsystems vertrieb GmbH
Страна происхождения:  Великобритания
Год выпуска:  2009
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Атомно-адсорбционный спектрофотометр
Марка:  AA6300
Фирма-изготовитель:  Shimadzu (Шимадзу)
Страна происхождения:  Япония
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Вертикальный морозильник сверхнизких температур (-85С)
Марка:  SANYO
Фирма-изготовитель:  SANYO
Страна происхождения:  Япония
Год выпуска:  2005
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Лабораторная установка для измерения наноразмерных частиц
Марка:  Zetasizer Nano ZS
Фирма-изготовитель:  Malvern Instruments
Страна происхождения:  Великобритания
Год выпуска:  2010
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Настольный ферментер-биореактор
Марка:  BioFlo/CelliGen 115
Фирма-изготовитель:  New Brunswick
Страна происхождения:  Нидерланды
Год выпуска:  2014
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Проточный цитометр
Марка:  EPICS XL 4
Фирма-изготовитель:  Beckman Coulter Inc
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Респирометр замкнутого цикла
Марка:  Micro-oxymax
Фирма-изготовитель:  Columbus Instruments
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Система высокоэффективной жидкостной хроматографии
Марка:  LC-20AD
Фирма-изготовитель:  Shimadzu
Страна происхождения:  Япония
Год выпуска:  2012
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Система детекции продуктов ПЦР в реальном времени, амплификатор CFX Connect
Марка:  CFX Connect
Фирма-изготовитель:  Bio-Rad Laboratories
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2014
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Система для флэш-хроматографии с набором картриджей
Марка:  Sepacore C601/610
Фирма-изготовитель:  BUCHI
Страна происхождения:  Швейцария
Год выпуска:  2014
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Теплообменник инкубатор-шейкер для культивирования микроорганизмов
Марка:  3033
Фирма-изготовитель:  GFL
Страна происхождения:  Германия
Год выпуска:  2003
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Установка для секвенирования ДНК
Марка:  MEGABase
Фирма-изготовитель:  Amershem Bio-science
Страна происхождения:  Великобритания
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Хромато-масс-спектрометр
Марка:  6890/5973N MSD
Фирма-изготовитель:  Agilent Technologies (Аджилент Текнолоджиз)
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2002
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Электронная термостабилизационная система
Марка:  Freeze Dryer Alpha 1-2 LD
Фирма-изготовитель:  CHRICT GmbH
Страна происхождения:  Германия
Год выпуска:  2003
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Услуги ЦКП (номенклатура — 0 ед.):

Для подачи заявки на оказание услуги щелкните по ее наименованию
Нет данных.

Методики измерений, применяемые в ЦКП (номенклатура — 14 ед.):

Методика получения закрепленных в криогеле поливинилового спирта клеток актинобактерий
Методика уникальна:  для России

Методика получения поликлональных иммунных сывороток против актинобактерий
Методика уникальна:  для России

Методика лиофилизации коллекционных культур алканотрофных актинобактерий
Методика уникальна:  для России

Методика определения адгезивной активности клеток актинобактерий в отношении гидрофобных субстратов
Методика уникальна:  для России

Методика определения термодинамических показателей адгезии актинобактерий к углеводородам
Методика уникальна:  для России

Методика получения адсорбированных на органических носителях клеток актинобактерий
Методика уникальна:  для России

Методика иммунофлуоресцентного анализа природных образцов с помощью видоспецифичных поливалентных иммунных сывороток
Методика уникальна:  для России

Методика прямой ПЦР-детекции экологически значимых видов родококков в нефтезагрязненной почве
Методика уникальна:  для России

Методика определения коэффициента комплексообразования ионов металлов с Rhodococcus-биосурфактантами
Методика уникальна:  для России

Методика криоконсервации коллекционных культур алканотрофных актинобактерий
Методика уникальна:  для России

Методика определения сульфидокисляющей активности актинобактерий
Методика уникальна:  для России

Методика хемотаксономического анализа чистых культур актинобактерий
Методика уникальна:  для России

Методика селективного выделения углеводородокисляющих актинобактерий из природных образцов
Методика уникальна:  для России

Методика спектрофотометрического определения жизнеспособности иммобилизованных в криогеле клеток родококков
Методика уникальна:  для России

Вернуться к списку ЦКП

 

Для просмотра сайта поверните экран