Ваш браузер устарел!

Браузер, которым вы пользуетесь для просмотра этого сайта, устарел и не соответствует современным технологическим стандартам Интернета.

Вы можете установить последнюю версию подходящего браузера, воспользовавшись ссылками ниже:


Вернуться к списку ЦКП

Центр коллективного пользования «Коллекция биоматериалов (ДНК, РНК и плазма) пациентов, страдающих мультифакторными социально-значимыми заболеваниями»

Сокращенное наименование ЦКП: КБМЗ ИХБФМ СО РАН

Базовая организация: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук

Ведомственная принадлежность: ФАНО России

Год создания ЦКП: 2017

Сайт ЦКП: http://www.niboch.nsc.ru/doku.php/md_collection

Заказать услуги ЦКП

Контактная информация:

Местонахождение ЦКП:

  • Федеральный округ: Сибирский
  • Регион: Новосибирская область
  • 630090, г. Новосибирск, просп. Ак. Лавреньева, д. 8

Руководитель ЦКП:

  • Филипенко Максим Леонидович, кандидат биологических наук
  • +7 (383) 3635170
  • max@niboch.nsc.ru

Контактное лицо:

Сведения о результативности за 2017 год (данные ежегодного мониторинга)

Участие в мониторинге: нетЧисло организаций-пользователей, ед.: 0Число публикаций, ед.: 0Загрузка в интересах внешних организаций-пользователей, %: 0.00

Краткое описание ЦКП:

Центр коллективного пользования «Коллекция биоматериалов (ДНК, РНК и плазма) пациентов, страдающих мультифакторными социально-значимыми заболеваниями» образован на базе лаборатории фармакогеномики Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН. ЦКП обеспечивает проведение широкомасштабных исследований (генетических ассоциативных, фармакогенетических и др.) на уникальных репрезентативных выборках пациентов. Основной целью деятельности центра является создание фонда реперзентативных выборок большинства социально-значимых мультифакторных заболеваний, как то рассеянный склероз, болезнь Паркинсона, сахарный диабет, рак молочной железы и других, с целью проведения исследований как учеными и клиницистами России, так и для участия в международных консорциумах.

Направления научных исследований, проводимых в ЦКП:

  • формирование, сохранение и обеспечение доступного коллекционного фонда биоматериалов (ДНК, РНК, плазма) пациентов, страдающих мультифакторными социально-значимыми заболеваниями, для использования в исследованиях молекулярных механизмов развития заболеваний;
  • исследования молекулярных основ различий в эффективности терапии.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):

    Науки о жизни

Научное оборудование ЦКП: (номенклатура — 30 ед.)

CFX96 Real-Time System C1000 Thermal Cycler
Марка:  C1000 Thermal Cycler
Фирма-изготовитель:  Bio-Rad Laboratories
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2010
Количество единиц:  3
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

iQ5 MULTICOLOR REAL TIME PCR DETECTION
Марка:  iQ5
Фирма-изготовитель:  Bio-Rad Laboratories
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2000
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

LIGHTCYCLER 96 Real-Time PCR System
Марка:  LIGHTCYCLER
Фирма-изготовитель:  Roshe
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2013
Количество единиц:  2
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Ph-метр ph-150м
Марка:  рН-метр милливольтметр рН-150М
Фирма-изготовитель:  Гомельский завод измерительных приборов
Страна происхождения:  Белоруссия
Год выпуска:  2002
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Аквадистиллятор
Марка:  ДЭВС-4
Фирма-изготовитель:  Liston
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2009
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  не указано

Бокс бактериальный воздушной среды
Марка:  БАВнп-01
Фирма-изготовитель:  Ламинар-С
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2013
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  не указано

Весы аналитические
Марка:  HR-150AZ
Фирма-изготовитель:  AND
Страна происхождения:  Япония
Год выпуска:  2017
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Вортекс
Марка:  V-1 plus
Фирма-изготовитель:  BioSan
Страна происхождения:  Латвия
Год выпуска:  2015
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Детектор высокопроизводительный автоматизированный проточный для анализа генной копийности
Марка:  ПЦР QX100
Фирма-изготовитель:  Bio-Rad Laboratories
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2013
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Камера морозильная Атлант М 7204-100
Марка:  М 7204-100
Фирма-изготовитель:  Атлант
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2015
Количество единиц:  2
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Камера морозильная Атлант ММ 184
Марка:  ММ 184
Фирма-изготовитель:  Атлант
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2009
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Льдогенератор
Марка:  СВ 416
Фирма-изготовитель:  BREMA
Страна происхождения:  Италия
Год выпуска:  2010
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Облучатель-рециркулятор медицинский "Armed"
Марка:  СН511-115 (пластиковый корпус)
Фирма-изготовитель:  Armed
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2014
Количество единиц:  3
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Секвинатор abi prism 310a
Марка:  ABI Prism 310
Фирма-изготовитель:  Applied Biosystems
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2000
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Система гель-документирования
Марка:  Gel Doc XR
Фирма-изготовитель:  Bio-Rad Laboratories
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Система пиросеквенирования
Марка:  pyroMark
Фирма-изготовитель:  Biotage
Страна происхождения:  Швеция
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Спектрофотометр
Марка:  NanoDrop
Фирма-изготовитель:  Thermo
Страна происхождения:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2013
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Стерилизатор DGM 200
Марка:  DGM 200
Фирма-изготовитель:  Pharma Apparate Handel AG
Страна происхождения:  Швейцария
Год выпуска:  2010
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  не указано

Стерилизатор паровой вк-75-01
Марка:  вк-75-01
Фирма-изготовитель:  Фармстандарт
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2004
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Термостат электрический суховоздушный ТС 1/80 СПУ
Марка:  ТС 1/80 СПУ
Фирма-изготовитель:  РМП Медтехника
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2013
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Термошейкер модель TS-100 с термоблоком
Марка:  TS-100
Фирма-изготовитель:  BioSan
Страна происхождения:  Латвия
Год выпуска:  2015
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Термошейкер ТS-1000С с охлаждением
Марка:  ТS-1000С
Фирма-изготовитель:  BioSan
Страна происхождения:  Латвия
Год выпуска:  2016
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Холодильник BEKO DS 333020
Марка:  DS 333020
Фирма-изготовитель:  BEKO
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2015
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Холодильник INDESIT
Марка:  Холодильник INDESIT
Фирма-изготовитель:  INDESIT
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2010
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Холодильник низкотемпературный Forma 88500V
Марка:  88500V
Фирма-изготовитель:  Forma
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2013
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  не указано

Центрифуга LMC-4200R
Марка:  LMC-4200R
Фирма-изготовитель:  BioSan
Страна происхождения:  Латвия
Год выпуска:  2013
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Центрифуга 5810 R
Марка:  5810 R
Фирма-изготовитель:  Eppendorf (Эппендорф)
Страна происхождения:  Германия
Год выпуска:  2004
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Центрифуга MiniSpin
Марка:  MiniSpin
Фирма-изготовитель:  Eppendorf (Эппендорф)
Страна происхождения:  Германия
Год выпуска:  2015
Количество единиц:  2
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Шейкер PSU-10i с платформой
Марка:  PSU-10i
Фирма-изготовитель:  BioSan
Страна происхождения:  Латвия
Год выпуска:  2016
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Шкаф холодильный ШХ-0,7Н Эльтон
Марка:  ШХ-0,7Н
Фирма-изготовитель:  Эльтон
Страна происхождения:  Россия
Год выпуска:  2014
Количество единиц:  2
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Услуги ЦКП: (номенклатура — 6 ед.)

Для подачи заявки на оказание услуги щелкните по ее наименованию

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):  Науки о жизни
Краткое описание услуги:  Данная услуга включает определение генотипов полиморфного локуса ДНК на основе классического TaqMan. ПЦР-смесь содержит два аллель-специфичных зонда с различными флуорофорами. В процессе амплификации зонды конкурируют за связывание с матрицей в участке с SNP, при этом преимущество получает зонд, соответствующий представленному в образце аллелю. Если присутствует оба аллеля, то оба зонда будут гибридизоваться с одинаковой вероятностью. После гибридизации зонды расщепляются за счет экзонуклеазной активности Taq полимеразы, и детектируется нарастание флуоресценции. Проверка качества образца производится в момент депонирования в КБМЗ ИХБФМ СО РАН и перед включением образца в исследование.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):  Науки о жизни
Краткое описание услуги:  Данная услуга включает определение генотипов полиморфного локуса ДНК на основе анализа плавления дуплексов. ПЦР смесь содержит зонд с гасителем на 3’-конце, гибридизующийся на участок с SNP, прямой праймер без модификаций и обратный праймер с флуорофором на 5’конце. На первом этапе проводится ассиметричная ПЦР, в результате которой преимущественно образуется меченый флуорофором одноцепочечный продукт, имеющий в своем составе участок для гибридизации зонд. На втором этапе проводится плавление дуплексов: начиная с 25°C, температура реакционной смеси повышается до 95°C шагами по 0,5°C, на каждом шаге считывается флуоресценция. При 25°C все одноцепочечные продукты амплификации находятся в гибридизованном состоянии с зондом (флуорофор и гаситель сближены в составе дуплексов). В результате повышения температуры дуплексы начинают разрушаться, при этом флуорофор и гаситель также разобщаются, что приводит к повышению флуоресценции, которую фиксирует амплификатор с детектирующей системой в режиме реального времени. В результате обработки кривых плавления с помощью программного обеспечения амплификатора определяются температуры плавления дуплексов. Дискриминация аллелей осуществляется за счет разницы в температурах плавления полностью комплементарных дуплексов и дуплексов с мисматчем. За счет дискриминации аллелей по температурам плавления дуплексов, обеспечивается высокая специфичность анализа, так наличие соответствующего пика на графике с обработанными кривыми плавления однозначно свидетельствует о наличии искомого аллеля. Проверка качества образца производится перед включением образца в исследование.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):  Науки о жизни
Краткое описание услуги:  Метод включает определение генотипов полиморфного локуса ДНК методом ассиметричной ПЦР - при амплификации концентрация одного из олигопраймеров в несколько десятков раз превосходит концентрацию другого праймера, в результате чего синтезируется преимущественно только одна, нужная для секвенирования цепочка ДНК. Проверка качества образца производится перед включением его в исследование.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):  Науки о жизни
Краткое описание услуги:  Данная услуга включает процедуры контроля качества полученного биологического материала, проверку полноты сведений, представленных в сопроводительной документации, и заполнения на него учетной документации. Выделение ДНК с помощью фенол-хлороформной экстракции, как описано в СОП-ЛФ-ВДНК-001. Хранение ДНК при контролируемых условиях, целесообразных требованиям, предъявляемым к биоматериалу, перед его исследованием или иной формой обращения.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):  Науки о жизни
Краткое описание услуги:  Данная услуга включает процедуры контроля качества полученного биологического материала, проверку полноты сведений, представленных в сопроводительной документации, и заполнения на него учетной документации. Отделение плазмы от форменных элементов крови. Хранение плазмы в низкотемпературном холодильнике, обеспечивающем постоянное поддержание температуры на уровне минус 78 - 80 С.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):  Науки о жизни
Краткое описание услуги:  Данная услуга включает процедуры контроля качества полученного биологического материала, проверку полноты сведений, представленных в сопроводительной документации, и заполнения на него учетной документации. Хранение аликвоты биоматериала при контролируемых условиях, целесообразных требованиям до ее исследования. Выделение РНК осуществляется согласно СОП-ЛФ-ВРНК-001.

Методики измерений, применяемые в ЦКП: (номенклатура — 6 ед.)

Идентификация и характеризация биоматериала пациентов
Методика уникальна:  нет

Выделение циркулирующей ДНК из плазмы
Методика уникальна:  нет

Выделение РНК из биоматериала пациентов
Методика уникальна:  нет

Контроль качества образцов биоматериала
Методика уникальна:  нет

Хранение биоматериала (ДНК, РНК, плазма) пациентов
Методика уникальна:  нет

Выделение ДНК из биоматериала пациентов
Методика уникальна:  нет

Вернуться к списку ЦКП

 

Для просмотра сайта поверните экран