Центры коллективного пользования

Межинститутский Центр коллективного пользования «ГЕНОМ» ИМБ РАН («ГЕНОМ»)

ЦКП создан в 2001 году

Данный ЦКП был поддержан в рамках мероприятия 5.2 ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направления развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы»
Данный ЦКП был поддержан в рамках мероприятия 3.1.2 ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направления развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы»
Адрес
Руководитель
  • 👤Кудрявцева Анна Викторовна
  • 📞(499) 1352391
  • rhizamoeba@mail.ru
Контактное лицо
  • 👤Кудрявцева Анна Викторовна
  • 📞(499) 1352391
  • rhizamoeba@eimb.ru
Сведения о результативности за 2016 год (данные мониторинга)
Участие в мониторинге Число организаций-пользователей, ед. Число публикаций, ед. Загрузка в интересах внешних организаций-пользователей, %
да11185.77
Базовая организация

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук

Информация о центре коллективного пользования (ЦКП)

Направления научных исследований

  • биология, молекулярная и клеточная инженерия, биоинженерия;
  • онкогеномика, онкодиагностика, онкопрогностика, онковирусология;
  • подвижные и повторяющиеся генетические элементы животных и их эволюция;
  • молекулярная иммунология;
  • структура и молекулярная динамика биополимеров;
  • создание новых биологически активных соединений;
  • генетическая энзимология;
  • передача сигнала на молекулярном и клеточном уровнях;
  • геномная и протеомная биоинформатика;
  • разработка фундаментальных основ новых молекулярных и клеточных технологий, бионанотехнологии;
  • геномика растений.

Приоритетные направления
119991, г. Москва, ул. Вавилова, 32
📷

Оборудование (49)

Наименование Страна Фирма-изготовитель Марка Год
Флуориметр Qubit 2.0 (Invitrogen)
Соединённые Штаты Америки Invitrogen Qubit 2.0 2014
Система для цифровой ПЦР QX200 Droplet Digital PCR System
Соединённые Штаты Америки Boi-Rad QX200 Droplet Digital PCR System 2016
Секвенатор MiniSeq
Соединённые Штаты Америки Illumina Inc. MiniSeq 2016
Анализатор клеточного метаболизма Seahorse XFe Analyzer
Соединённые Штаты Америки Agilent Technologies (Аджилент Текнолоджиз) Seahorse XFe Analyzer 2016
Система ультразвуковой фрагментации молекул Covaris S220 System
Соединённые Штаты Америки Thermo Fisher Scientific Covaris S220 System 2015
Прибор MagNA Pure Compact
Швейцария Roche MagNA Pure Compact 2015
Система фракционирования нуклеиновых кислот и белков Sage ELF EL00082
Соединённые Штаты Америки Sage Science Sage ELF EL00082 2015
Амплификатор ДНК
Соединённые Штаты Америки Applied Biosystems GeneAmp 9700 2012
Спектрофотометр NanoDrop 1000 (Thermo Scientific)
Соединённые Штаты Америки Thermo Scientific NanoDrop 1000 2007
Комплекс вспомогательного оборудования для проведения этапа подготовки образцов для их последующего секвенирования на секвенаторах нового поколения Eppendorf
Соединённые Штаты Америки Eppendorf (Эппендорф) Eppendorf 2013
Система для выделения и манипуляций отдельными клетками DEPArray System (Silicon Biosystems)
Италия Silicon Biosystems DEPArray System 2014
Комплекс оборудования для подготовки геномных библиотек с целью последующего секвенирования на секвенаторах нового поколения
Соединённые Штаты Америки Eppendorf (Эппендорф) Eppendorf 2013
Система для концентрирования биомолекул 5305 Concentrator plus Complete System (Eppendorf)
Соединённые Штаты Америки Eppendorf (Эппендорф) 5305 Eppendorf Concentrator plus 2015
Система высокопроизводительного секвенирования NextSeq500 System (Illumina)
Соединённые Штаты Америки Illumina Inc. NextSeq 500 System 2015
Высокопроизводительная система на основе метода ПЦР Access Array (Fluidigm)
Соединённые Штаты Америки Fluidigm Fluidigm Access Array 2014
Ламинарный шкаф II класса биологической защиты Labconco
Германия Labconco Labconco 2007
Инвертированный микроскоп Leica DMI 3000 B
Швейцария Leica Geosystems AG DMI 3000 B 2013
Система для автоматического твердофазного синтеза нуклеиновых кислот с фотометрическим контролем, K-A Laborgeraete
Канада Laborgeraete K-A 2012
Комплекс для модернизации вычислительных мощностей геномного анализатора-секвенатора Illumina GAIIx STSS Flagman QX8516T4.2
Швеция Flagman QX8516T4.2 2013
Автоматический анализатор нуклеиновых кислот с детекцией в режиме реального времени LightCycler 480
Швейцария Roche LightCycler 480 2013
Система высокопроизводительного секвенирования MiSeq System (Illumina)
Соединённые Штаты Америки Illumina Inc. MiSeq System 2013
Низкотемпературный морозильник (кельвинатор)
- наиболее востребованное оборудование
Соединённые Штаты Америки NuAire NU 9483E 2010
Камера для вертикального электрофореза
- приобретено в рамках государственного контракта
Россия Хеликон SE-2 2012
Вспомогательный комплекс для первичной идентификации и сепарации биомолекул
- приобретено в рамках государственного контракта
Invitrogen, Хеликон Safe Image 2.0 (RT), VE-10, SE-2 2012
Система гель-электрофореза
- приобретено в рамках государственного контракта
- наиболее востребованное оборудование
Швейцария Lonza FlashGel Doc System Lonza 2012
Портативный флуориметр для измерения в УФ-синем спектре
- приобретено в рамках государственного контракта
Соединённые Штаты Америки Promega QuantiFluor-ST 2012
Биосовместимая полупрепаративная ВЭЖХ-система на базе хроматографа
- приобретено в рамках государственного контракта
- дорогостоящее оборудование
Соединённые Штаты Америки Dionex Ultimate 3000 2012
Лабораторный инвертированный микроскоп
- приобретено в рамках государственного контракта
- дорогостоящее оборудование
Япония Nikon TS100FLED 2012
Установка для десольватации образцов (лиофильная сушка) в составе камера для образцов
- приобретено в рамках государственного контракта
VITARIS AG, Milestone SRL ScanCool 55-4 Pro, CCS200 2012
Основной комплекс для первичной идентификации и сепарации биомолекул
- приобретено в рамках государственного контракта
- наиболее востребованное оборудование
Bio-Rad, BioSan, Eppendorf Sub-Cell GT, Mini-Protean 2D Cell, Эльф-8, Микроспин BS FV-2400, Eppendorf Research+ 2012
Многофункциональная центрифуга
- приобретено в рамках государственного контракта
Германия Eppendorf MiniSpin plus 5810 2012
Прибор для проведения полимеразной цепной реакции в режиме реального времени rotor-Gene Q Rotor-Gene Q 5 plex HRM (Qiagen)
Германия Qiagen Rotor-Gene Q 5 plex HRM 2012
Гель-документирующая система GelDoc XR, Biorad
- приобретено в рамках государственного контракта
Соединённые Штаты Америки Bio-Rad GelDoc XR+ 2012
Бидистиллятор стекляный
- приобретено в рамках государственного контракта
- наиболее востребованное оборудование
Германия GFL GFL-2302 2012
Лазер для автоматического секвенатора ДНК
- приобретено в рамках государственного контракта
- наиболее востребованное оборудование
Соединённые Штаты Америки Applied Biosystems ABI 3730 2012
Микро-Дисмембратор
Германия Sartorius Mikro-Dismembrator U 2012
Амплификатор GeneAmp
Соединённые Штаты Америки Applied Biosystems GeneAmp 2720 2012
Амплификатор для ПЦР реальном времени 7500 Real-Time PCR System (Applied)
Соединённые Штаты Америки Applied biosystems 7500 Real-Time PCR System 2011
Лаборатория геномного анализа на основе системы секвенирования GS Junior (Roche)
Швейцария Roche GS Junior 2012
Геномный анализатор-секвенатор (Автоматический оптический сканер для высокопроизводительного считывания первичной последовательности цепи гетерополимеров) Illumina GAIIx
- дорогостоящее оборудование
- наиболее востребованное оборудование
Соединённые Штаты Америки Illumina Illumina GAIIx 2010
Генетический 48 капилярный анализатор (секвенатор) модели ABI PRISM 3730
- дорогостоящее оборудование
- наиболее востребованное оборудование
Соединённые Штаты Америки Applied Biosystems ABI PRISM 3730 2005
Система документации гелей Bio-Rad Molecular Imager Gel Doc XR System
Соединённые Штаты Америки Bio-Rad Bio-Rad Molecular Imager Gel Doc XR System 2007
Комплекс для амплификации ДНК в комплекте (Alpha-блок,амплификатор РТС) РТС-220 DNA Dyad (Bio-Rad)
Соединённые Штаты Америки Bio-Rad РТС-220 DNA Dyad 2009
Комплекс приборов Eppendorf для центрифугирования, амплификации и микродозирования образцов ДНК
- дорогостоящее оборудование
Германия Eppendorf Eppendorf 2007
Вертикальный лабораторный морозильник
- наиболее востребованное оборудование
Япония Sanyo SanyoMDF-U537D 2007
Вертикальный лабораторный морозильник
- наиболее востребованное оборудование
Япония Sanyo SanyoMDF-U537D 2007
Ламинарный шкаф II класса биологической защиты Labconco
Германия Labconco Labconco 2008
Биоанализатор Agilent 2100
- дорогостоящее оборудование
- наиболее востребованное оборудование
Соединённые Штаты Америки Agilent Technologies Agilent 2100 2007
Анализатор генетический Avant 3100
- дорогостоящее оборудование
Соединённые Штаты Америки Applied Biosystems Avant 3100 2003

Услуги (44)

Для подачи заявки на оказание услуги щелкните по ее наименованию.
Наименование Приоритетное направление
Построение калибровочной кривой в двойных логарифмических координатах. Получение линейного регрессионного уравнения для пептида
Науки о жизни
Формирование по пептиду отчета, включающего следующие параметры: а) концентрация пептида, б) площадь пика, в) симметричность пика, г) отношение сигнала к шуму, д) время удержания
Науки о жизни
Обработка MRM-данных, полученных для пептида, в специализированном программном обеспечении MassHunter Data analysis
Науки о жизни
Количественное определение уровня экспрессии генов на анализаторе нуклеотидных последовательностей АВI PRISM 7500 Applied Biosystems (США)
Науки о жизни
Генотипирование - анализ SNP на автоматическом секвенаторе фирмы Applied Biosystems (США) модель ABI PRISM 3100 AVANT (4 капил.)
Науки о жизни
Секвенирование ДНК после бисульфитной обработки на капиллярном автоматическом анализаторе Applied Biosystems (США) модель АВI 3730 (48 капил.)
Науки о жизни
Биоинформатический анализ результатов секвенирования на Illumina GAIIx (1 дорожка), оценка экспрессии генов
Науки о жизни
Биоинформатический анализ результатов секвенирования (1 запуск), ампликонный анализ. (GS Amplicon Variant Analyzer)
Науки о жизни
Секвенирование на приборе Illumina GAIIx, 1 дорожка, с двух концов, длина чтения 150пн
Науки о жизни
Секвенирование на приборе Illumina GAIIx, 1 дорожка, с двух концов, длина чтения 100пн
Науки о жизни
Секвенирование на приборе Illumina GAIIx, 1 дорожка, с двух концов, длина чтения 35пн
Науки о жизни
Секвенирование на приборе Illumina GAIIx, 1 дорожка, с одного конца, длина чтения 150пн
Науки о жизни
Секвенирование на приборе Illumina GAIIx, 1 дорожка, с одного конца, длина чтения 100пн
Науки о жизни
Секвенирование на приборе Illumina GAIIx, 1 дорожка, с одного конца, длина чтения 75пн
Науки о жизни
Секвенирование на приборе Illumina GAIIx, 1 дорожка с одного конца, длина чтения 35пн
Науки о жизни
Приготовление библиотек с помощью набора для пробоподготовки Nextera для секвенирования на приборе Illumina GAIIX с последующей оценкой качества
Науки о жизни
Комплекс работ от выделения ДНК из образца заказчика до получения сиквенса с "shotgun" библиотекой
Науки о жизни
Секвенирование на приборе GS Junior, 1/4 запуска
Науки о жизни
Секвенирование на приборе GS Junior, 1 запуск
Науки о жизни
Приготовление “shotgun” библиотеки с выделением ДНК из образца заказчика со всеми необходимыми проверками
Науки о жизни
Выделение ДНК из образца заказчика с проверкой качества на спектрофотометре Nanodrop
Науки о жизни
Оценка концентрации ДНК на флюориметре при помощи набора PicoGreen Assay (Invitrogen) (перед приготовлением “shotgun” библиотек)
Науки о жизни
Оценка концентрации “shotgun” библиотеки с адапторами, конъюгированными с флюоресцеином, при помощи флюориметра
Науки о жизни
Приготовление библиотек из РНК для секвенирования на приборе GS Junior, Roche
Науки о жизни
Приготовление ампликоновой библиотеки с использованием фьюжн-праймеров для секвенирования на приборе GS Junior, Roche
Науки о жизни
Приготовление “shotgun” библиотеки для секвенирования на приборе GS Junior, Roche
Науки о жизни
Фрагментный анализ образцов ДНК
Науки о жизни
Секвенирование ДНК на генетическом секвенаторе ABI 3730
- наиболее востребованная услуга
Науки о жизни
Оценка концентрации РНК на приборе Qubit
Науки о жизни
Оценка концентрации двухцепочечной ДНК на приборе Qubit
Науки о жизни
Биоинформатический анализ данных, 1 час работы биоинформатика с использованием вычислительного кластера
Науки о жизни
Биоинформатический анализ данных, 1 час работы биоинформатика с использованием персонального компьютера
Науки о жизни
Биоинформатический анализ результатов секвенирования на Illumina GAIIX (1 дорожка), картирование с использованием референсной последовательности
Науки о жизни
Биоинформатический анализ результатов секвенирования на Illumina GAIIX (1 дорожка), de-novo сборка с использованием программ сторонних разработчиков
Науки о жизни
Биоинформатический анализ результатов секвенирования на приборе GS Junior (1 запуск), картирование с использованием референсных последовательностей
Науки о жизни
Биоинформатический анализ результатов секвенирования на приборе GS Junior (1 запуск), de-novo сборка
Науки о жизни
Секвенирование на приборе Illumina GAIIX, 1 дорожка, с двух концов, длина чтения 75 пн
Науки о жизни
Проведение реакции ПЦР в режиме реального времени с праймерами и зондами, предоставленными заказчиком, 1 планшет на 96 реакций
Науки о жизни
Приготовление библиотек с помощью набора для пробоподготовки TruSeq для секвенирования на приборе Illumina GAIIX с последующей оценкой качества
Науки о жизни
Секвенирование на приборе GS Junior, 1/2 запуска
Науки о жизни
Гомогенизация образца заказчика жидком азоте перед выделением нуклеиновых кислот
Науки о жизни
Проверка качества ДНК на биоанализаторе Agilent 2100 при помощи высокочувствительного чипа (проверка качества библиотеки)
Науки о жизни
Проверка качества РНК на биоанализаторе Agilent 2100 (1-10шт)
- наиболее востребованная услуга
Науки о жизни
Выделение РНК из биологического образца, предоставленного заказчиком
Науки о жизни

Методики (11)

Наименование методики Наименование организации, аттестовавшей методику Дата аттестации
Высокопроизводительное секвенирование на приборе NextSeq 500 Illumina
Оценка концентрации нуклеиновых кислот на приборе Qubit (согласно методике производителя)
Оценка концентрации нуклеиновых кислот на флюориметре при помощи набора PicoGreen Assay (Invitrogene)
Методики проверки качества нуклеиновых кислот на биоанализаторе 2100 при помощи высокочувствительного чипа (согласно протоколам производителя)
Стандартные молекулярно-биологические методики (проведение электрофореза, клонирование фрагментов ДНК, полимеразная цепная реакция, выделение нуклеиновых кислот и белков, очистка белков, проведение гибридизаций др.)
Стандартные методы работы с использованием конфокальной, в том числе мультифотонной микроскопии
Методы проведения высокопродуктивного секвенирования на платформе фирмы Roche (согласно протоколам производителя)
Методы проведения высокопродуктивного секвенирования на платформе фирмы Illumina, США (согласно протоколам производителя)
Методы исследований, проводимых при помощи системы для полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, а именно количественно оценка уровня экспрессии, количества копий, аллельная дискриминация (согласно протоколам производителя)
Фрагментный анализ флуоресцентномеченных молекул ДНК на автоматическом секвенаторе фирмы Applied Biosystems (США) модель ABI PRISM 3100 AVANT (согласно протоколам производителя)
Методы определения нуклеотидной последовательности фрагменов ДНК при помощи секвенатора Applied Biosystems, США (согласно протоколам производителя)

Возврат к списку


0 комментариев

Комментарии отсутствуют!

Вы можете оставить свое сообщение первым.

Написать комментарий