Протеомный анализ
Сокращенное наименование ЦКП: Протеомный анализ
Базовая организация: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины»
Ведомственная принадлежность: Минобрнауки России
Год создания ЦКП: 2008
Сайт ЦКП: http://niimbb.ru/proteom/
Контактная информация:
Местонахождение ЦКП:
|
Руководитель ЦКП:
|
Контактное лицо:
|
Сведения о результативности за 2021 год (данные ежегодного мониторинга)
|
Краткое описание ЦКП:
Центр протеомных исследований |
Направления научных исследований, проводимых в ЦКП:
|
Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):
|
Приоритетные направления Стратегии НТР (п. 20):
|
Фотографии ЦКП:








Научное оборудование ЦКП (номенклатура — 20 ед., нет данных о загрузке за 2022 год):
Анализатор автоматический для проведения ПЦР-анализа в режиме реального времени LightCycler® 96 Instrument (Roche Diagnostics GmbH)
Высокопроизводительный комбинированный квадруполь-времяпролетный масс-спектрометр maXis Impact (Bruker Daltonik GmbH)
Генетический секвенатор MiSeq Illumina
Жидкостный хроматограф LC-30 Nexera (Shimadzu)
Лиофильная сушилка пилотная LP30
Модуль для высокопроизводительного многопараметрического анализа биообразцов lnCell Analyzer 2200 System (GE Healthcare)
Модуль оптического анализа на основе конфокального сканирования Typhoon FLA 9500 Imager scanner
Низкотемпературный морозильник Platinum 750V
Низкотемпературный морозильник Platinum 750V
Низкотемпературный морозильник Upright Freezer
Программно-аппаратный комплекс для проведения лазерной микродиссекции биологических объектов с возможностью бесконтаминационного извлечения частей для последующего биохимического анализа или рекультивации на базе AXIO OBSERVER Palm MicroBeam (Carl Zeiss)
ПЦР амплификатор в реальном времени CFX96
Секвенатор по Сэнгеру SeqStudio
Система V3 Western Workflow для блоттинга и визуализации гелей
Система для двумерного электрофореза белков в комплектации (Bio-Rad Laboratories)
Система для проведения цифровой количественной амплификации нуклеиновых кислот QX200 AutoDG Droplet Digital PCR System (Bio-rad Laboratories)
Система ПЦР в реальном времени QuantStudio 5 (OC5570)
Система ПЦР в реальном времени QuantStudio 5 (OC5571)
Термоциклер для амплификации нуклеиновых кислот CFX96 Touch (Bio-Rad Laboratories)
Флюоресцентный микроскоп для лабораторных исследований Axio Imager.M2 |
Услуги ЦКП (номенклатура — 2 ед.):
Краткое описание услуги: Качественный и количественный анализ белков в различных видах тканей Краткое описание услуги: 1. Проведение учебных занятий студентов, прохождение практик, стажировка специалистов. 2. Сопровождение научным оборудованием научно-исследовательских работ докторов, кандидатов, аспирантов, магистров, студентов. 3. Подготовка кадров высшей квалификации |
Методики измерений, применяемые в ЦКП (номенклатура — 36 ед.):
Оценка фенотипических изменений клеточных популяций методом двойного окрашивания фиксированных клеток препаратами хехст и DiD
Методика уникальна:
для России
Вырезание белковых бандов или точек из одно- и двумерных гелей и блотов и подготовки образцов для последующего масс-спектрометрического анализа белков
Методика уникальна:
нет
Методика детекции белков с использованием специфичных антител
Окрашивание гелей и мембран с использованием колориметрических, флюоресцентных, хемилюминисцентных красителей
Методика уникальна:
нет
Проведение вертикального электрофореза малого и большого размеров для разделения белков по массе, позволяющего одновременно работать с количеством гелей до 12 штук, в том числе в гелях с градиентным распределением плотности
Методика уникальна:
нет
Проведение препаративной изоэлектрофокусировки белков по pI в растворе малых объемов (2,5 мл)
Методика уникальна:
нет
Регистрации цветного, флюоресцентного и хемилюменисцентного изображения с последующими обработкой и анализом одно- и двумерных гелей и мембран, в том числе для получения двумерной белковой карты
Методика уникальна:
нет
NGS секвенирование
Методика уникальна:
нет
Проведение исследований на новую коронавирусную инфекцию
Наименование организации, аттестовавшей методику :
Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Новосибирской области (Управление Роспотребнадзора по Новосибиской области) Дата аттестации: 01.06.2020 Методика уникальна: нет
Анализ проникновения микрочастиц в клетки путем регистрации флуоресцентного сигнала от микрочастиц
Методика уникальна:
нет
Получение флюоресцентных изображений клеток, окрашенных различними антителами
Методика уникальна:
нет
Прижизненная окраска флюоресцентными красителями для оценки морфологии внутриклеточных органелл
Методика уникальна:
нет
Секвенирование по Сэнгеру
Методика уникальна:
нет
Анализ методом цифровой количественной ПЦР
Методика уникальна:
нет
Исследование проникновения и выведения флюоресцентных препаратов в клетку в реальном времени
Методика уникальна:
нет
Оценка образования в клетках активных форм кислорода с использованием DCF в реальном времени
Методика уникальна:
нет
Анализ локализации и распределения флуоресцентно-меченых белков в живых клетках
Методика уникальна:
нет
Оценка токсичности перитонеальных макрофагов мыши методом окрашивания аннексином и пропидиум иодидом
Методика уникальна:
нет
Анализ локализации и распределения флуоресцентно-меченых белков на фиксированных препаратах тканевых срезов
Методика уникальна:
нет
Получение и анализ изображений клеток в светлом поле
Методика уникальна:
нет
Анализ методом ПЦР в режиме реального времени
Методика уникальна:
нет
Детекция клеток в реальном времени: анализ клеточной адгезии и миграции
Методика уникальна:
нет
Изучение клеточной жизнеспособности и пролиферации
Методика уникальна:
нет
Оценка токсичности химических соединений методом двойного окрашивания клеток препаратами хехст и пропидиум иодид с последующим подсчетом процента живых метрвых и апоптотических клеток
Методика уникальна:
нет
Иммуногистохимический анализ
Методика уникальна:
нет
Изоляция лазерным микродиссектором клонов и клеток определенного типа с последующим культивированием, изучение взаимодействия клеток в культуре
Методика уникальна:
нет
Лазерная микродиссекция препаратов из образцов замороженных и фиксированных тканей с использованием традиционных микроскопических методов: светлое поле, темное поле, освещение поляризованным светом, фазовый контраст и флуоресценция
Методика уникальна:
нет
Высокоэффективная жидкостная хроматография с возможностью спектрофотометрической (UV/Vis), флуоресцентной и электрохимической детекции
Методика уникальна:
нет
Аллель-специфичная ПЦР
Методика уникальна:
нет
Анализ экспрессии генов методом полимеразной цепной реакции (ПЦР-анализ)
Методика уникальна:
нет
Таргетное секвенирование ДНК
Методика уникальна:
нет
Хромато-масс-спектрометрический анализ пептидов
Методика уникальна:
нет
Физико-химическое разделение веществ: повседневная обработка образцов, центрифугирование, экстракция, очистка, концентрирование разделение фаз, колоночное и фильтрующее центрифугирование; быстрое осаждение белка, крупных частиц, обрывков клеток; приготовление субклеточных органелл, таких как митохондрии, ядра, незрелые микросомы;разделение клеток крови и клеточных компонентов; осаждение нуклеиновой кислоты; градиентное разделение.
Методика уникальна:
нет
Электрофоретическое разделение нуклеиновых кислот в агарозном и акриламидном гелях
Методика уникальна:
нет
Разделение белков по их изоэлектрическим параметрам в геле для стрипов и стеклянных трубочек различной длины и диапозонов рН
Методика уникальна:
нет
Электроблоттинг белков
Методика уникальна:
нет |