Ваш браузер устарел!

Браузер, которым вы пользуетесь для просмотра этого сайта, устарел и не соответствует современным технологическим стандартам Интернета.

Вы можете установить последнюю версию подходящего браузера, воспользовавшись ссылками ниже:


Вернуться к списку ЦКП

Ассоциация центров коллективного пользования «Биоинженерия»

Сокращенное наименование ЦКП: ЦКП «Биоинженерия»

Базовая организация: Федеральное государственное учреждение «Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» Российской академии наук»

Ведомственная принадлежность: Минобрнауки России

Год создания ЦКП: 2003

Сайт ЦКП: http://www.fbras.ru/services/ckp/ckp-bioinzheneriya

Заказать услуги ЦКП

Контактная информация:

Местонахождение ЦКП:

  • Федеральный округ: Центральный
  • Регион: г. Москва
  • 119071, г. Москва, Ленинский проспект, д. 33, стр. 2

Руководитель ЦКП:

  • Колганова Татьяна Владимировна, кандидат технических наук, старший научный сотрудник
  • +7 (499) 1351240
  • moldiag@biengi.ac.ru

Контактное лицо:

  • Колганова Татьяна Владимировна, кандидат технических наук, старший научный сотрудник
  • +7 (499) 1351240
  • moldiag@biengi.ac.ru, ackp@biengi.ac.ru

Сведения о результативности за 2020 год (данные ежегодного мониторинга)

Участие в мониторинге: даЧисло организаций-пользователей, ед.: 18Число публикаций, ед.: 15Загрузка в интересах внешних организаций-пользователей, %: 40.14

Краткое описание ЦКП:

Центр коллективного пользования «Биоинженерия» организован в 2003 году, как структурное подразделение Центра «Биоинженерия» РАН (ФИЦ Биотехнологии РАН) .Деятельность ЦКП направлена на обеспечение  современным научным оборудованием исследований  в области высокопроизводительной геномики, молекулярной диагностики и биоинженерии по следующим направлениям развития науки, технологий и техники в Российской Федерации (Указ Президента Российской Федерации от 7 июля 2011 года № 899): «Науки о жизни», «Рациональное природопользование» . ЦКП обеспечивает инфраструктурную поддержку научных программ и проектов в сфере приоритетных национальных фундаментальных и прикладных научных исследований для реализации стратегии научно-технологического развития Российской Федерации. ЦКП «Биоинженерия» предоставляет возможность проведения исследований на имеющемся уникальном оборудовании внешним организациям. За время существования в ЦКП его услугами воспользовались более чем 100 организаций России, стран СНГ и зарубежья.
ЦКП оснащен комплексом современного высокопроизводительного уникального научного оборудования, который включает высокопроизводительные секвенаторы фирм Illumina, Oxfrod Nanopore Technology, Applied Biosystems (3730 и 3500XL) ; амплификаторы ДНК, в том числе в режиме реального времени; атомно-силовым микроскопом и др. Методы секвенирования обеспечены метрологической поддержкой. На оборудовании ЦКП выполнены проекты по секвенированию XII хромосомы картофеля (результаты исследований опубликованы в журнале Nature), проведено NGS секвенирование и аннотация свыше100 геномов бактерий и архей, проанализировано более 500 сообществ микроорганизмов . Проведена идентификация более  5000 чистых культур микроорганизмов.
В ЦКП Биоинженерия проводятся научные исследования биоразнообразия, таксономии, эволюции, генетической инженерии магнитотактических бактерий.

Направления научных исследований, проводимых в ЦКП:

  • NGS cеквенирование и анализ геномов прокариот (Miseq, Illumina);
  • Сиквенс метагенома на платформах Illumina и Nanopore;
  • Анализ сообщества микроорганизмов по v3-v4 региону 16S,анализ ампликонов (Miseq, Illumina) - Секвенирование по Сэнгеру ( ABI 3730,3500XL);
  • Идентификация чистых культур микроорганизмов на основе секвенироваиня по Сэнгеру 16S рРНК, 18S рРНК , ITS-региона , и других функциональных генов (gyrB, recA, rpoB и др);
  • Определение штаммовой принадлежности микроорганизма методом RAPD-PCR;
  • Анализ аллельного полиморфизма сельскохозяйственных растений методом Real-Time PCR;
  • Разработка молекулярных маркеров для идентификации функциональных групп прокариот;
  • Верификация методов идентификации ГМО в продуктах питания и растительном сырье;
  • Исследования по изучению биоразнообразия, таксономии, эволюции, и генетической инженерии магнитотактических бактерий.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):

    Науки о жизни

Приоритетные направления Стратегии НТР (п. 20):

  • персонализированная медицина, высокотехнологичное здравоохранение и технологии здоровьесбережения
  • экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Фотографии ЦКП:

Научное оборудование ЦКП (номенклатура — 14 ед., средняя загрузка — 4%):

Автоматический капиллярный секвенатор ДНК ABI 3730 (Applied Biosystems)
Загрузка прибора: 4%
Марка:  ABI 3730
Фирма-изготовитель:  Applied Biosystems Inc
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1

Генетический анализатор 4300 (Li-Cor)
Загрузка прибора: нет данных за 2021 год
Марка:  4300
Фирма-изготовитель:  Li-Cor
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1

Генетический анализатор Miseq (Illumina)
Загрузка прибора: 4%
Марка:  miseq
Фирма-изготовитель:  Illumina
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2016
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

ДНК-амплификатор Tetrad (MJR)
Загрузка прибора: 4%
Марка:  Tetrad
Фирма-изготовитель:  MJR
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  3

Компьютерный кластер
Загрузка прибора: нет данных за 2021 год
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Россия
Год выпуска:  2003
Количество единиц:  1

Лаборатория для исследования физических свойств объектов со сверхвысоким разрешением Интегра Прима (НТ-МДТ)
Загрузка прибора: нет данных за 2021 год
Марка:  Интегра Прима
Фирма-изготовитель:  НТ-МДТ
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Россия
Год выпуска:  2010
Количество единиц:  1

Лабораторная установка повышенной степени чистоты
Загрузка прибора: 4%
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Россия
Год выпуска:  2003
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Масс-спектрометр Ultraflex III MALDI-TOF/TOF (Bruker)
Загрузка прибора: нет данных за 2021 год
Марка:  Ultraflex III
Фирма-изготовитель:  Bruker Corporation
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Германия
Год выпуска:  2015
Количество единиц:  1

Пиросеквенатор ДНК 454 GS FLX (Roche)
Загрузка прибора: нет данных за 2021 год
Марка:  454 GS FLX
Фирма-изготовитель:  Roche
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Швейцария
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  нет

Система анализа последовательностей молекул ДНК IonTorrent (Illumina)
Загрузка прибора: нет данных за 2021 год
Марка:  IonTorrent
Фирма-изготовитель:  Illumina Inc.
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2012
Количество единиц:  1

Система для проведения пульс-электрофореза ДНК CHEF DR III Chiller (BioRad)
Загрузка прибора: нет данных за 2021 год
Марка:  CHEF DR III Chiller
Фирма-изготовитель:  BioRad
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1

Система сбора данных BioDocAnalyser II (Biometra)
Загрузка прибора: нет данных за 2021 год
Марка:  BioDocAnalyser II
Фирма-изготовитель:  Biometra
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Германия
Год выпуска:  2003
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  не указано

Термоциклер для проведения ПЦР анализа в реальном времени CFX96(BioRad)
Загрузка прибора: нет данных за 2021 год
Марка:  CFX96
Фирма-изготовитель:  Bio-Rad Laboratories
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2010
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  не указано

Хемидокументирующая система Fusion Solo.6X PRO FO.70
Загрузка прибора: нет данных за 2021 год
Марка:  Fusion Solo.6X PRO FO.70
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2020
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  не указано

Услуги ЦКП (номенклатура — 10 ед.):

Для подачи заявки на оказание услуги щелкните по ее наименованию

Краткое описание услуги:  Выделение ДНК, постановка ПЦР (v3-v4), генерация не менее 10000 последовательностей на MiSeq (Illumina)в формате 2 х 300 нт., первичная биоинформационная обработка данных
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  ответ на большие вызовы с учетом взаимодействия человека и природы, человека и технологий, социальных институтов; экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Краткое описание услуги:  Выделение геномной ДНК из биологического материала
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  экологически чистая и ресурсосберегающая энергетика, глубокая переработка углеводородного сырья, новые источники энергии

Краткое описание услуги:  1. Проводим выделение ДНК из исследуемого организма. 2. С использованием праймеров, специфичных для 16S рРНК эубактерий или архей, амплифицируем полноразмерный ПЦР-фрагмент гена, кодирующего 16S рРНК. 3. Секвенируем по полученный ПЦР-фрагмент на анализаторе ABI 3730(3500XL), сравниваем полученную последовательность (длина не менее 1300 пн)с последовательностями генов 16S рРНК из баз данных, определяем ближайшие виды
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  ответ на большие вызовы с учетом взаимодействия человека и природы, человека и технологий, социальных институтов; экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Краткое описание услуги:  1. Проводим выделение ДНК из исследуемого организма. 2. Получаем ПЦР-копию генов 18S рРНК ,ITS-регион или других маркеров по запросу. 3. Секвенируем полученные ПЦР-фрагменты, определяем ближайшие последовательности из имеющихся в базах данных (BLAST-анализ)
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  экологически чистая и ресурсосберегающая энергетика, глубокая переработка углеводородного сырья, новые источники энергии; экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Краткое описание услуги:  определение состава микробного сообщества на Real-Time PCR CFX-96
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  персонализированная медицина, высокотехнологичное здравоохранение и технологии здоровьесбережения; экологически чистая и ресурсосберегающая энергетика, глубокая переработка углеводородного сырья, новые источники энергии

Краткое описание услуги:  Выделение ДНК исследуемого и референсного образца RAPD-PCR с использованием 4 праймерных систем . Референсный контроль предоставляет Заказчик
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  экологически чистая и ресурсосберегающая энергетика, глубокая переработка углеводородного сырья, новые источники энергии; экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Краткое описание услуги:  Выделение ДНК, подготовка библиотеки, секвенированиеIllumina (не менее чем 50-кратное покрытие генома), первичная биоинформационная обработка (сборка контигов, аннотация).
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  экологически чистая и ресурсосберегающая энергетика, глубокая переработка углеводородного сырья, новые источники энергии; экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Краткое описание услуги:  Выделение ДНК, подготовка геномных библиотек, секвенирование на платформах Illumina и Oxford Nanopore, первичная биоинформационная обработка (сборка полной геномной последовательности).
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  экологически чистая и ресурсосберегающая энергетика, глубокая переработка углеводородного сырья, новые источники энергии; экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Краткое описание услуги:  Предоставление заинтересованным лицам зарегистрированного Федеральным агентством по техническому регулированию и метрологии стандартного образца утвержденного типа ГСО11368-2019 для поверки, калибровка и испытаний амплификаторов с детекцией в режиме реального времени.
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  ответ на большие вызовы с учетом взаимодействия человека и природы, человека и технологий, социальных институтов; экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Краткое описание услуги:  Секвенирование ПЦР-фрагмента ДНК, рестрикционного фрагмента ДНК, клонированного фрагмента ДНК в составе вектора и.т.д.
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Методики измерений, применяемые в ЦКП (номенклатура — 10 ед.):

Высопроизводительное секвенирование геномов, определение состава микробных сообществ
Методика уникальна:  нет

Методика определения содержания трансгенной кукурузы GA21 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006
Методика уникальна:  для России

Методика определения содержания трансгенной кукурузы MON801 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика определения содержания трансгенной кукурузы NK603 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика определения содержания трансгенной кукурузы Т25 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика определения содержания трансгенной сои RR40-3-2 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика секвенирования геномной ДНК исследуемого организма
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям
Дата аттестации:  03.10.2011

Методика секвенирования клональной вставки
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям
Дата аттестации:  03.10.2011

Методика секвенирования ПЦР-фрагмента ДНК
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям
Дата аттестации:  03.10.2011

СО массовой концентрации ДНК плазмиды pUC18 в водном растворе
Наименование организации, аттестовавшей методику :  Федеральное агентство по техническому регулированию и метрологии
Дата аттестации:  19.09.2019
Методика уникальна:  для России

Вернуться к списку ЦКП

 

Для просмотра сайта поверните экран