Ваш браузер устарел!

Браузер, которым вы пользуетесь для просмотра этого сайта, устарел и не соответствует современным технологическим стандартам Интернета.

Вы можете установить последнюю версию подходящего браузера, воспользовавшись ссылками ниже:


Вернуться к списку ЦКП

Ассоциация центров коллективного пользования «Биоинженерия»

Сокращенное наименование ЦКП: ЦКП «Биоинженерия»

Базовая организация: Федеральное государственное учреждение «Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» Российской академии наук»

Ведомственная принадлежность: Минобрнауки России

Год создания ЦКП: 2003

Сайт ЦКП: http://www.fbras.ru/services/ckp/ckp-bioinzheneriya

Заказать услуги ЦКП

Контактная информация:

Местонахождение ЦКП:

  • Федеральный округ: Центральный
  • Регион: г. Москва
  • 119071, г. Москва, Ленинский проспект, д. 33, стр. 2

Руководитель ЦКП:

  • Колганова Татьяна Владимировна, кандидат технических наук, старший научный сотрудник
  • +7 (499) 1351240
  • moldiag@biengi.ac.ru

Контактное лицо:

  • Колганова Татьяна Владимировна, кандидат технических наук, старший научный сотрудник
  • +7 (499) 1351240
  • moldiag@biengi.ac.ru, ackp@biengi.ac.ru

Сведения о результативности за 2019 год (данные ежегодного мониторинга)

Участие в мониторинге: даЧисло организаций-пользователей, ед.: 17Число публикаций, ед.: 23Загрузка в интересах внешних организаций-пользователей, %: 45.62

Краткое описание ЦКП:

Центр коллективного пользования «Биоинженерия» организован в 2003 году, как структурное подразделение Центра «Биоинженерия» РАН (ФИЦ Биотехнологии РАН) для обеспечения  современным научным оборудованием исследований  в области высокопроизводительной геномики, молекулярной диагностики и биоинженерии.
ЦКП оснащен комплексом современного высокопроизводительного уникального научного оборудования – высокопроизводительные секвенаторы фирм Illumina, Oxfrod Nanopore Technology, Applied Biosystems, амплификаторами ДНК, масс-спектрометром, атомно-силовым микроскопом. Методы секвенирования обеспечены метрологической поддержкой. На оборудовании ЦКП выполнены проекты по секвенированию XII хромосомы картофеля (результаты исследований опубликованы в журнале Nature), более 100 геномов бактерий и архей, диатомовой водоросли и митохондриального генома возбудителя описторхоза Opistorchis felineus. ЦКП «Биоинженерия» предоставляет возможность проведения исследований на имеющемся уникальном оборудовании внешним организациям. За время существования в ЦКП его услугами воспользовались более чем 100 организаций России, стран СНГ и зарубежья.
Спектр предлагаемых услуг ЦКП включает:
         Секвенироваине ДНК по Сэнгеру
        Идентификация микроорганизмов на основе сравнительного анализа генов, кодирующих рибосомную РНК
         Секвенирование и анализ геномов прокариот
          Филогенетика и таксономия прокариот
          Исследование видового разнообразия микробных сообществ
          Анализ аллельного полиморфизма
         Разработка молекулярных маркеров для идентификации функциональных групп прокариот
          Разработка и верификация методов идентификации ГМО в продуктах питания и растительном сырье
          Предоставление заинтересованным лицам зарегистрированного Федеральным агентством по техническому регулированию и метрологии стандартного образца утвержденного типа ГСО11368-2019 для поверки, калибровка и испытаний амплификаторов с детекцией в режиме реального времени.
В ЦКП Биоинженерия проводятся научные исследования биоразнообразия, таксономии, эволюции, генетической инженерии магнитотактических бактерий.

Направления научных исследований, проводимых в ЦКП:

  • Идентификация чистых культур микроорганизмов на основе сравнительного анализа генов, кодирующих рибосомную РНК;
  • Секвенирование ДНК по Сэнгеру;
  • Высокопроизводительное секвенирование и анализ геномов;
  • Филогенетика и таксономия прокариот;
  • Исследование видового разнообразия микробных сообществ методами высокопроизводительного секвенирования;
  • Количественный состав природных сообществ методом RT-PCR;
  • Анализ аллельного полиморфизма методом RT-PCR;
  • Разработка молекулярных маркеров для идентификации различных функциональных групп про- и эукариот;
  • Разработка и верификация методов идентификации ГМО в продуктах питания и растительном сырье;
  • В ЦКП Биоинженерия проводятся научные исследования биоразнообразия, таксономии, эволюции, генетической инженерии магнитотактических бактерий.

Приоритетные направления (указ Президента РФ N 899):

    Науки о жизни

Приоритетные направления Стратегии НТР (п. 20):

  • персонализированная медицина, высокотехнологичное здравоохранение и технологии здоровьесбережения
  • экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Фотографии ЦКП:

Научное оборудование ЦКП (номенклатура — 19 ед., средняя загрузка — 12%):

Автоматический капиллярный секвенатор ДНК ABI 3730 (Applied Biosystems)
Загрузка прибора: 70%
Марка:  ABI 3730
Фирма-изготовитель:  Applied Biosystems Inc
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1

Анализатор однонуклеотидных полиморфизмов ДНК Illumina5
Загрузка прибора: 222%
Марка:  Illumina5
Фирма-изготовитель:  Illumina
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1

Генетический анализатор 4300 (Li-Cor)
Загрузка прибора: 8%
Марка:  4300
Фирма-изготовитель:  Li-Cor
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1

Генетический анализатор AVANT 3100 (ABI)
Загрузка прибора: 0%
Марка:  AVANT 3100
Фирма-изготовитель:  ABI
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2002
Количество единиц:  1

ДНК амплификатор в комплекте 350 (Parallab)
Загрузка прибора: 0%
Марка:  350
Фирма-изготовитель:  Parallab
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Швейцария
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1

ДНК-амплификатор Tetrad (MJR)
Загрузка прибора: 7%
Марка:  Tetrad
Фирма-изготовитель:  MJR
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  3

Компьютерный кластер
Загрузка прибора: 12%
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Россия
Год выпуска:  2003
Количество единиц:  1

Лаборатория для исследования физических свойств объектов со сверхвысоким разрешением Интегра Прима (НТ-МДТ)
Загрузка прибора: 4%
Марка:  Интегра Прима
Фирма-изготовитель:  НТ-МДТ
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Россия
Год выпуска:  2010
Количество единиц:  1

Лабораторная установка повышенной степени чистоты
Загрузка прибора: 9%
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Россия
Год выпуска:  2003
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  да

Масс-спектрометр Ultraflex III MALDI-TOF/TOF (Bruker)
Загрузка прибора: 3%
Марка:  Ultraflex III
Фирма-изготовитель:  Bruker Corporation
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Германия
Год выпуска:  2015
Количество единиц:  1

Пиросеквенатор ДНК 454 GS FLX (Roche)
Загрузка прибора: 0%
Марка:  454 GS FLX
Фирма-изготовитель:  Roche
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Швейцария
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1

Робот для раскапывания реакционных смесей Biomek 2 (Bekmann Coultier)
Загрузка прибора: 0%
Марка:  Biomek 2
Фирма-изготовитель:  Bekmann Coultier
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Германия
Год выпуска:  2006
Количество единиц:  1

Система анализа последовательностей молекул ДНК IonTorrent (Illumina)
Загрузка прибора: 0%
Марка:  IonTorrent
Фирма-изготовитель:  Illumina Inc.
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2012
Количество единиц:  1

Система для проведения пульс-электрофореза ДНК CHEF DR III Chiller (BioRad)
Загрузка прибора: 3%
Марка:  CHEF DR III Chiller
Фирма-изготовитель:  BioRad
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1

Система подготовки нуклеиновых кислот ABI PRISM 6100
Загрузка прибора: 0%
Марка:  ABI PRISM 6100
Фирма-изготовитель:  ABI
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2004
Количество единиц:  1

Система сбора данных BioDocAnalyser II (Biometra)
Загрузка прибора: 6%
Марка:  BioDocAnalyser II
Фирма-изготовитель:  Biometra
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Германия
Год выпуска:  2003
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  не указано

Счетчик частиц Z1 (Beckman)
Загрузка прибора: 0%
Марка:  Z1
Фирма-изготовитель:  Beckman Coulter
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1

Термоциклер для проведения ПЦР анализа в реальном времени CFX96(BioRad)
Загрузка прибора: 4%
Марка:  CFX96
Фирма-изготовитель:  Bio-Rad Laboratories
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2010
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  не указано

Фрагментатор ДНК Hydroshear (Genomic Solutions Inc.)
Загрузка прибора: 0%
Марка:  Hydroshear
Фирма-изготовитель:  Genomic Solutions Inc.
Страна происхождения фирмы-изготовителя:  Соединённые Штаты Америки
Год выпуска:  2007
Количество единиц:  1
Наличие сертификата и других признаков метрологического обеспечения:  не указано

Услуги ЦКП (номенклатура — 6 ед.):

Для подачи заявки на оказание услуги щелкните по ее наименованию

Краткое описание услуги:  Высокопроизводительное секвенирование на Miseq (Illumina)
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  ответ на большие вызовы с учетом взаимодействия человека и природы, человека и технологий, социальных институтов; экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Краткое описание услуги:  1. Проводим выделение ДНК из исследуемого организма. 2. С использованием праймеров, специфичных для 16S рРНК эубактерий или архей, амплифицируем полноразмерный ПЦР-фрагмент гена, кодирующего 16S рРНК. 3. Секвенируем по полученный ПЦР-фрагмент на анализаторе ABI 3730, сравниваем полученную последовательность с последовательностями генов 16S рРНК из баз данных, определяем ближайшие виды 4. По запросу заказчика строим филогенетические деревья, показывающие таксономическое положение исследованного микроорганизма. 5. По запросу заказчика депонируем полученную последовательность в базу данных GenBank. 6. По запросу заказчика формируем филогенетическое описание в публикацию.
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  ответ на большие вызовы с учетом взаимодействия человека и природы, человека и технологий, социальных институтов; экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Краткое описание услуги:  определение состава микробного сообщества на Real-Time PCR CFX-96
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  персонализированная медицина, высокотехнологичное здравоохранение и технологии здоровьесбережения; экологически чистая и ресурсосберегающая энергетика, глубокая переработка углеводородного сырья, новые источники энергии

Краткое описание услуги:  Предоставление заинтересованным лицам зарегистрированного Федеральным агентством по техническому регулированию и метрологии стандартного образца утвержденного типа ГСО11368-2019 для поверки, калибровка и испытаний амплификаторов с детекцией в режиме реального времени.
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  ответ на большие вызовы с учетом взаимодействия человека и природы, человека и технологий, социальных институтов; экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Краткое описание услуги:  Секвенирование ПЦР-фрагмента ДНК, рестрикционного фрагмента ДНК, клонированного фрагмента ДНК в составе вектора и.т.д.
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Краткое описание услуги:  1. Проводим выделение ДНК из исследуемого организма. 2. Получаем ПЦР-копию генов 18S рРНК ,ITS-регион или других маркеров по запросу. 3. Секвенируем полученные ПЦР-фрагменты, определяем ближайшие последовательности из имеющихся в базах данных (BLAST-анализ) 4. По запросу заказчика строим филогенетические деревья, показывающие таксономическое положение исследованного микроорганизма. 5. По запросу заказчика депонируем полученную последовательность в базу данных GenBank. 6. По запросу заказчика формируем филогенетическое описание в публикацию.
Приоритетные направления Стратегии НТР РФ (п. 20):  экологически чистая и ресурсосберегающая энергетика, глубокая переработка углеводородного сырья, новые источники энергии; экологически чистое агро- и аквахозяйство, защита сельскохозяйственных растений и животных, безопасные продукты питания

Методики измерений, применяемые в ЦКП (номенклатура — 9 ед.):

Методика определения содержания трансгенной кукурузы GA21 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006
Методика уникальна:  для России

Методика определения содержания трансгенной кукурузы MON801 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика определения содержания трансгенной кукурузы NK603 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика определения содержания трансгенной кукурузы Т25 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика определения содержания трансгенной сои RR40-3-2 в продуктах питания
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии « Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Дата аттестации:  05.02.2006

Методика секвенирования геномной ДНК исследуемого организма
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям
Дата аттестации:  03.10.2011

Методика секвенирования клональной вставки
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям
Дата аттестации:  03.10.2011

Методика секвенирования ПЦР-фрагмента ДНК
Наименование организации, аттестовавшей методику :  ФГУП ВНИИМС Федерального Агентства по метрологии и измерениям
Дата аттестации:  03.10.2011

СО массовой концентрации ДНК плазмиды pUC18 в водном растворе
Наименование организации, аттестовавшей методику :  Федеральное агентство по техническому регулированию и метрологии
Дата аттестации:  19.09.2019
Методика уникальна:  для России

Вернуться к списку ЦКП

 

Для просмотра сайта поверните экран